В статье рассматривается механизм предварительного отбора инновационных проектов с целью формирования эффективного инвестиционного портфеля предприятия. Предложен многокритериальный подход для оценки проектов, с применением метода нечетких множеств. Разработана система качественных показателей и предложена методика их бальной оценки с сопоставлением баллам трапециевидного нечеткого числа. Прогнозируемые денежные потоки инновационных проектов представлены в виде «размытых» значений, поэтому количественные показатели имеют также нечеткий числовой диапазон. Для получения интегральной оценки, проведена нормировка количественных показателей, в соответствии с их наилучшим значением. Обосновано преимущество метода, предложенного для ранжирования инновационных проектов. Применение метода нечетких множеств позволило провести количественный анализ риска, как для отдельных инновационных проектов, так и для портфеля в целом.